随着计算机技术、通讯技术以及互联网技术的迅猛发展和普及，以互联网为载体的电子健康档案、医疗信息查询、疾病风险评估、在线疾病咨询等多种形式的健康服务兴起，在医疗机构诊前、诊中、诊后不断得到应用，但在“互联网+医疗”建设方面仍面临一些问题。
一是信息化建设基础薄弱。截至目前，全市有13所二级及以上医疗机构，信息化建设水平达到2级的有3所，1级的有5所，0级的有5所。总体来看，信息化建设基础较差，难以实现医疗机构之间、医疗机构内部信息系统的互联互通，对推进“互联网+医疗”造成较大制约。
二是资金投入力度不够。根据国务院办公厅《关于促进“互联网+医疗健康”发展的意见》，鼓励发展覆盖诊前、诊中、诊后的线上线下一体化医疗服务模式，从政策上支持推动行业发展。随着消费者健康意识提升，治病需求向治未病需求延展，“互联网+”正在促进大健康生态发生变化。但是，从医疗机构应用来看，医疗机构需要大量的资金投入，而全市医疗机构医疗收入普遍偏低，资金有限，有的甚至没有建设经费。因此，对医疗卫生机构的“互联网+医疗健康”建设需要进一步加强财政支持，以满足发展的需求。
三是医保政策支持力度不强。目前，远程会诊费用已制定收费标准，《青海省医疗服务项目指导价格（2016版）》规定，三级医院300元/小时、二级医院280元/小时、一级医院240元/小时，每超过10分钟加收50元，而远程会诊收费尚未纳入医保报销范围。为加大对“互联网+医疗健康”政策的支持力度，进一步减轻上级医院的看病压力，促进医疗技术下沉基层，需要医保部门给予政策支持。
四是缺乏信息化专业人才。从全市医疗机构信息化建设现状来看，全市存在信息化管理人员和专业人员不足的问题，目前市、县区卫生健康行政部门仅有信息化专业人员1名，13所二级及以上医院编制内信息化专业人员仅有8名，平均每个医院不足1名，各医院对信息化建设方面普遍缺乏规划，对建成系统的后期维护和更新缺乏技术支持。同时，还存在系统建成后，由于系统开发公司不在青海省范围内，后期维护开发公司服务跟不上的现象，影响医疗机构对系统的正常使用。
五是缺乏互联网监管平台。目前，尚未建立“互联网+医疗健康”方面的监管平台，无法监管在互联网医院与患者间开展的医疗行为，无法甄别是否存在夸大病情、药品推销等医疗欺诈行为，难以对此类行为进行核查取证。
六是远程医疗专网运行质量不高。由于设备、网速等原因，存在远程会诊、远程视频会议图像不清楚、卡动、声音模糊不清等问题，需要进一步提高远程医疗专网网速，提高服务器运行能力。